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測試背景
目前(qian),超聲波破(po)碎(sui)儀(yi)(yi)是(shi)常(chang)用(yong)的一種DNA片段化設備。然而,目前(qian)的超聲波破(po)碎(sui)儀(yi)(yi)需要(yao)在(zai)操作之前(qian)使用(yong)傳統的DNA提取(qu)方法提取(qu)基因(yin)組(zu)DNA。這個過程(cheng)通(tong)常(chang)需要(yao)1到3 h才(cai)能獲得基因(yin)組(zu)DNA。
因此,我(wo)們迫(po)切需(xu)要一種能(neng)(neng)夠節約成本、縮短(duan)DNA提取時間、簡化操作步驟(zou),并(bing)且能(neng)(neng)夠滿足獲(huo)得不同長度片段(duan)需(xu)求的一步法制(zhi)備片段(duan)化DNA的裝置。我(wo)司基于以上需(xu)求,對非接觸式超(chao)聲(sheng)波細胞粉碎機(ji)SCIENTZ 08-IIIC這款儀器進(jin)行功能(neng)(neng)測(ce)試(shi)
儀器與試劑
SCIENTZ 08-IIIC、水平電泳儀(yi)、凝膠成(cheng)像儀(yi)、HSC-2015L高速離心機、微量分光光度計(ji)、制冰機、超凈臺、SLC-2006恒溫(wen)槽(cao)。
DNA提取檢測試劑盒、無水乙醇、TAE、瓊脂糖、核酸染料、2000 DNA Ladder、6×Loading Buffer、RNase A。
測試方案:動物樣品的處理
1.取適(shi)量縊蟶(cheng)組織放入離(li)心(xin)管(guan)中,離(li)心(xin)管(guan)中加入適(shi)量裂(lie)解(jie)液及酶溶液。
2.設置(zhi)超聲頻率、功率、工作時間及恒(heng)溫槽溫度。
3.將超聲打斷后的樣(yang)品(pin)簡短離(li)心取上清,進行(xing)濃(nong)度及電泳檢測。
實驗結果與分析
Fig. 1 Electrophoretic detection of genomic DNA samples and fragmented DNA samples
與常規提取DNA再打(da)(da)斷的方法(fa)相(xiang)比直接從(cong)組織中(zhong)打(da)(da)斷后的樣品DNA片(pian)段大小均勻分布在100-250 bp區(qu)間,有輕微拖帶現象,濃度極高。
結論
非接觸式超聲波細胞粉碎(sui)機SCIENTZ 08-IIIC能夠作(zuo)為一種簡短有效的方(fang)法(fa)用于一步法(fa)從(cong)組織(zhi)中獲得片段DNA。