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測試背景
目(mu)(mu)前,超聲波破碎(sui)儀是常用的(de)(de)一(yi)種DNA片段化設(she)備。然而(er),目(mu)(mu)前的(de)(de)超聲波破碎(sui)儀需要在操作之前使用傳統的(de)(de)DNA提取方法提取基因(yin)組(zu)(zu)DNA。這個(ge)過程通常需要1到3 h才(cai)能獲(huo)得基因(yin)組(zu)(zu)DNA。
因此,我們迫切(qie)需(xu)(xu)要(yao)一(yi)種能夠節(jie)約成本(ben)、縮短DNA提取時間、簡(jian)化操作步(bu)驟(zou),并且能夠滿足獲得不同長度片段需(xu)(xu)求的(de)(de)一(yi)步(bu)法制備片段化DNA的(de)(de)裝置(zhi)。我司(si)基(ji)于以上需(xu)(xu)求,對非(fei)接觸式超聲波細(xi)胞粉碎機SCIENTZ 08-IIIC這(zhe)款儀(yi)器(qi)進行功能測(ce)試
儀器與試劑
SCIENTZ 08-IIIC、水平電泳儀(yi)、凝(ning)膠成像(xiang)儀(yi)、HSC-2015L高速離(li)心(xin)機(ji)、微(wei)量分(fen)光光度計(ji)、制冰機(ji)、超(chao)凈臺、SLC-2006恒溫(wen)槽。
DNA提取(qu)檢(jian)測試(shi)劑盒、無水乙醇、TAE、瓊脂(zhi)糖、核酸染料、2000 DNA Ladder、6×Loading Buffer、RNase A。
測試方案:動物樣品的處理
1.取適(shi)量(liang)(liang)縊蟶(cheng)組(zu)織放(fang)入離心管中(zhong),離心管中(zhong)加入適(shi)量(liang)(liang)裂(lie)解液及(ji)酶溶液。
2.設置超(chao)聲頻率(lv)、功率(lv)、工(gong)作時間及恒溫槽溫度。
3.將超聲(sheng)打斷后(hou)的樣品簡短離心(xin)取上清(qing),進行濃度及(ji)電泳(yong)檢(jian)測。
實驗結果與分析
Fig. 1 Electrophoretic detection of genomic DNA samples and fragmented DNA samples
與常規提取DNA再打斷的方法相(xiang)比直接從組織中(zhong)打斷后的樣品(pin)DNA片段(duan)大小均勻(yun)分布在100-250 bp區間(jian),有輕微(wei)拖(tuo)帶現象,濃(nong)度極高。
結論
非接觸式超(chao)聲波細胞粉碎(sui)機SCIENTZ 08-IIIC能夠作為一(yi)種簡短(duan)有效(xiao)的(de)方(fang)法用于一(yi)步法從組織(zhi)中(zhong)獲得(de)片段(duan)DNA。