產品說明(ming)
超聲波DNA打(da)斷(duan)儀，一次最(zui)(zui)高處(chu)理量(liang)為12個(ge)樣(yang)品(pin)，最(zui)(zui)小(xiao)體積為5μl。對于每天要處(chu)理多個(ge)樣(yang)品(pin)或(huo)者貴(gui)重樣(yang)品(pin)的實驗室，它具有處(chu)理高通量(liang)，樣(yang)本低(di)損耗，無交叉污染等優勢。逐漸(jian)成為ChIP(染色質(zhi)免疫共沉淀)和DNA剪切研(yan)究平臺不可缺少的標準化工(gong)具。
工作(zuo)原理
超(chao)聲(sheng)波(bo)DNA打斷儀通過(guo)壓電轉換器(qi)，將電信(xin)號轉變為(wei)高頻聲(sheng)波(bo)信(xin)號，產生數百(bai)萬的(de)水分(fen)子”空(kong)穴(xue)”，利用“空(kong)穴(xue)” 在(zai)幾微秒內變大、破(po)裂產生的(de)瞬時(shi)流體剪(jian)切力，通過(guo)等溫、非接觸的(de)方式對樣品進行打斷、勻(yun)漿和(he)混合。
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| LOW | HIGH |
| 工(gong)作原理示意圖 |
應(ying)用領域
? 高通量測序(xu)樣本前處理 ? ChIP assay （染色質(zhi)免(mian)疫(yi)共(gong)沉(chen)淀）樣本前處理 ; ? 超聲均質、乳化制備為微懸浮液 ? 貴重試劑超聲處理 |
產品特點
? 重復性(xing)好 可(ke)精準控制樣(yang)本處理過程，實驗(yan)結果重復(fu)性(xing)高 ? 樣(yang)本損(sun)耗小 最小可處理5μl ? 處理效(xiao)率高 樣本處理速度快，一次最多可處理12個樣本 ? 片段范圍廣 100-1000bp ? 樣(yang)本零(ling)污染 非接觸式封閉破碎，最大程度降低污染風險 ? 適用范圍廣(guang) 不同樣本只需調節超聲參數，降低了實驗成本 ? 等溫處理(li) 標配冷卻水循環系統，避免溫度過高對樣本造成損壞 |
實驗效果
實驗條件與方法
1. DNA樣本來(lai)源：gDNA來(lai)源于λ噬菌體(ti)，濃度為：20 ng/ul 。 2. 實驗參數設置：功率100 %；在(zai)打(da)斷總時長內，超聲10 s，間歇10s，循環打(da)斷；各樣本管編號及打(da)斷條件設置見(jian)下表 |
| 編號 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 |
| 打斷時間(min) | 4 | 4 | 4 | 5 | 5 | 5 | 7.5 | 7.5 | 7.5 | 10 | 10 | 10 | 15 | 15 | 15 |
| 打斷體積(ul) | 50 | 50 | 50 | 50 | 50 | 50 | 50 | 50 | 50 | 50 | 50 | 50 | 50 | 50 | 50 |
| 打斷管（ml) | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 | 0.2 |
實驗(yan)結(jie)果
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超聲波DNA打斷儀優勢
| 破碎方法 | 優點 | 缺點 |
| 超聲波DNA打斷儀 | 操作簡單；
耗時短；
效率高；
安全性高；
無交叉污染；
樣本需求量少；
微流動現象和空化效應均勻分布； | 影響片段大小的因素多，超聲體積、功率和時間等； |
| 酶切法 | 產率高；
樣本需求量少；
安全性高；
無交叉污染； | 存在序列偏好性；
耗時較長；
成本較高；
實驗條件要求嚴格； |
| 化學法 | 對未經克隆的DNA片段可以直接測序；
適合G或C含量較高的片段；
測序時5’和3’都可以標記； | 操作繁瑣，費時費力；
化學試劑毒性大；
放射性同位素標記效率偏低； |
